苹果发言人证实，Touch ID指纹识别功能不会将用户的指纹图像存储在iPhone 5S上，这样可以缓解隐私担忧。
新的Touch ID只会存储“指纹数据”，在iPhone处理器内数据是加密的。手机会利用数字签名解锁手机，或者在iTunes内购物。
换句话说，即使有人破解了iPhone的加密芯片，也不太可能获得用户的指纹。
iPhone 5S提供指纹识别的目的是增强**性，但它也引起一个担忧，由于设备会存储生物数据，可能侵犯隐私。指纹技术并不新鲜，但许多人仍没有用到。
苹果表示，开始时不会允许第三方应用使用扫描仪。
苹果新闻发言人还谈到手机的其它**功能，凡是使用Touch ID的用户会创建一个密码备用。如果手机重起或者48小时内未解锁，只有密码能让手机解锁，指纹无法解锁手机，这样就可以阻止黑客绕开指纹扫描仪黑进手机。
苹果还说，消费笔记本的指纹扫描仪并不稳定，苹果iPhone 5S有所改进。许多笔记本的扫描仪要扫几次才能识别，但是5S扫描仪同样不**。如果手指沾有液体，比如汗、洗涤液或者其它液体，指纹扫描仪有时会难以识别。
苹果发言人还指出，如果手指受伤也难以识别。
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